A CD3 kimutatható a korai thymocytákban és megjelenése valószínűleg a T-sejtvonal iránti elköteleződés egyik legkorábbi jele. A kortikális thymocytákban az antigén túlnyomórészt intracytoplazmatikus alkotóelemként van jelen. Ez az antitest a CD3ε-t jelöli és hasznos a T-sejtek illetve azokkal összefüggésben álló neoplazmák azonosításában.