A szövettan, citológia és egyéb, rokon tudományos diszciplínák a szövetek és sejtek mikroszkópos szerkezetét tanulmányozza. Ahhoz, hogy kiválóan láthatóvá tegyük a szöveti és sejtes struktúrákat, elengedhetetlen a minták helyes festése. A Methyl Green festékpor különböző mikroszkópos festési eljárásokban alkalmazható. A Pyronine Y festékkel együtt használva egylépéses DNS (zöld) és RNS (vörös) festési módszert tesz lehetővé. Emellett kontrasztfestékként is alkalmazzák más reakciók során, például enzimaktivitás kimutatására, valamint Altmann-féle mitokondrium jelölésre.