A PermaRed/AP-Auto kromogén szubsztrát rendszer vöröses színű jelet eredményez, a jelölődés intenzitásától függően a pinktől a brilliáns sötét vörösig. nem oldódik szerves oldószerekben, így a metszetek alkoholban vízteleníthetők, xilolban vagy xilol helyettesítő oldatokban deríthetők és permanens anyaggal fedhetők. A PermaRed/AP-Auto formula a tárgylemezen keverendő. A festőautomatákat úgy kell programozni a használata esetén, hogy az a szubsztrát puffer után vigye vel a kromogént a tárgylemezre. A szubsztrát puffer és a kromogén reagens önmagukban stabilak. A reagenstartóba helyezhetők a festési ciklus elején a többi reagenssel együtt.