A PermaRed/AP-Auto kromogén szubsztrát rendszer vöröses színű jelet eredményez, a jelölődés intenzitásától függően a pinktől a brilliáns sötét vörösig. nem oldódik szerves oldószerekben, így a metszetek alkoholban vízteleníthetők, xilolban vagy xilol helyettesítő oldatokban deríthetők és permanens anyaggal fedhetők.