A Glypican-3 (GPC3) egy glycosylphospatidyl inositol által rögzített membrán protein, szekretált formában szintén megtalálható. Az anti-GPC3 jó marker a hepatocelluláris carcinoma (HCC), hepatoblastoma, melanoma, here csírasejt tumor és Wilms’ tumor azonosítására. HCC esetekben a GPC3 túlexpresszálódik neoplasiás máj szövetben, ekkor mennyisége emelkedett a szérumban, de nem detektálható normál májban, jóindulatú daganatokban és egészséges szérumban. A GPC3 expressziója erőteljesebb a májban HCC esetén, mint cirrhosis vagy fokális léziók, diszplasztikus noduláris elváltozás vagy malignus transzformált adenoma esetén. A here csírasejtes tumorok esetében a GPC3 expressziójának fokozódása figyelhető meg egyes szövettani altípusoknál, mint a szikzacskó tumor és a choriocarcinoma. A GPC3 magas expressziója jellemző egyes embryonális tumorok, mint a Wilms’ tumor és a hepatoblastoma esetében, alacsony vagy nem detektálható kifejeződéssel az egészséges szomszédos szövetekben. A pajzsmirigy rákos betegségek egyes típusában a GPC3 expressziója drámai emelkedést mutat: folliculáris carcinoma esetek 100%-ában, papilláris carcinoma esetek 70%-ában. Folliculáris carcinomában jeletősen magasabb a GPC3 expresszió, mint folliculáris adenomában. Ezzel ellentétben a GPC3 nem fejeződik ki anaplasztikus carcinomában.